Diese Fehlermeldung kann auch daran liegen, daß eines der Zertifikatelemente nicht stimmt.
Bei Servern mit mehreren virtuellen Maschinen ist es (nach meiner Kenntnis) nicht einfach, den virtuellen Server mit dem falschen Zertifikat herauszufinden.
Ich habe die virtuellen Servern einzeln deaktiviert und „apache2“ immer wieder neu gestartet, bis die Fehlermeldung weg war.
Dann das Zertifikat und den „Key“ geprüft, bis ich dem Fehler auf die Schliche kam.
Übrigens sage ich seit Jahren, daß die Zertifikateproblematik die schwerwiegendste in der aktuellen IT ist: Falsche Zertifikate, falsche oder fehlende Prüfungen, abgelaufene Zertifikate etc.
Hier hilft nur eines: Dokumentation, sauber Buch führen und wie bei einer „Check-Liste“ die wichtigen Zertifikate periodisch prüfen.